學(xué)校創(chuàng)建于1956年，由上海第一醫(yī)學(xué)院（現(xiàn)復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院）分遷來渝組建，原名重慶醫(yī)學(xué)院，1985年更名為重慶醫(yī)科大學(xué)。學(xué)校是國務(wù)院學(xué)位委員會批準(zhǔn)的首批具有博士和碩士學(xué)位授予權(quán)的單位，是教育部批準(zhǔn)的首批來華留學(xué)示范基地。學(xué)校2015年成為重慶市人民政府、國家衛(wèi)生健康委員會（原國家衛(wèi)生計生委）和教育部共建高校，2016年成為“高等學(xué)校學(xué)科創(chuàng)新引智計劃”（“111計劃”）首批立項的地方高校之一。
學(xué)校由位于渝中區(qū)的袁家崗校區(qū)和位于重慶大學(xué)城的縉云校區(qū)組成，校園總面積2650畝，其中縉云校區(qū)占地2100畝。校園環(huán)境優(yōu)美，風(fēng)景如畫。
學(xué)校現(xiàn)有全日制在校學(xué)生25671人，其中博士、碩士研究生6529人，本科生18587人，留學(xué)生555人。學(xué)校具有招收博士后研究人員，港澳臺學(xué)生和外國留學(xué)生資格。學(xué)校現(xiàn)有7個一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)、12個一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，3個博士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點(diǎn)、10個碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點(diǎn)；4個國家重點(diǎn)學(xué)科，6個進(jìn)入ESI全球前1%的學(xué)科（2021年1月，科睿唯安發(fā)布），4個重慶市一流學(xué)科，12個重慶市“十三五”市級重點(diǎn)學(xué)科。在教育部學(xué)位中心第四輪學(xué)科評估中，臨床醫(yī)學(xué)等學(xué)科排名全國前列。
學(xué)校設(shè)有21個學(xué)院（系），并設(shè)立研究生院，開設(shè)36個本科專業(yè)。現(xiàn)有國家級一流本科專業(yè)建設(shè)點(diǎn)13個，重慶市一流本科專業(yè)建設(shè)點(diǎn)18個。臨床醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、中醫(yī)學(xué)專業(yè)已通過教育部專業(yè)認(rèn)證。現(xiàn)擁有1個國家臨床教學(xué)培訓(xùn)示范中心，4個國家級實(shí)驗教學(xué)示范中心，7門國家級一流課程，4門國家級精品資源共享課、3門國家級精品視頻公開課。
學(xué)校大力實(shí)施人才強(qiáng)校戰(zhàn)略，面向海外延攬高層次人才，成建制引進(jìn)多個具有國際水平的人才團(tuán)隊，加強(qiáng)本土人才引導(dǎo)與培育，逐步構(gòu)建起“近悅遠(yuǎn)來”的良好人才生態(tài)，形成推動內(nèi)涵式發(fā)展的強(qiáng)勁動力。
現(xiàn)有專任教師3200余人，其中正、副教授2000余人，博士生導(dǎo)師371人，碩士生導(dǎo)師1699人。現(xiàn)有中國工程院院士（外聘）、海外高層次人才、長江、杰青等國家級人才逾50人，省部級各類人才470余人。現(xiàn)有7個國家級博士后科研流動站，在站博士后規(guī)模達(dá)到227人，人才塔基和師資蓄水池作用日益明顯，人才隊伍活力不斷增強(qiáng)。
學(xué)校科技創(chuàng)新能力不斷提升。“十三五”期間，學(xué)校累計新增科技部、國家自然科學(xué)基金委等各級部門及橫向項目3200余項，資助經(jīng)費(fèi) 7.4億元；牽頭承擔(dān)了重大傳染病防治國家科技重大專項、國家重點(diǎn)研發(fā)計劃等國家級重大任務(wù)，資助經(jīng)費(fèi)超過1.2億元。發(fā)表SCI收錄論文6198篇，年均增長率達(dá)10.24%。多項成果在《柳葉刀》《自然·醫(yī)學(xué)》《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》等國際頂級期刊發(fā)表。獲得國家科技獎勵、重慶市科技獎勵40余項，2017年我校2項成果榮獲國家科技進(jìn)步二等獎，實(shí)現(xiàn)歷史性突破。 學(xué)校獨(dú)立研制的高強(qiáng)度聚焦超聲腫瘤治療系統(tǒng)（海扶刀）屬世界首創(chuàng)，是我國第一臺具有完全自主知識產(chǎn)權(quán)的大型醫(yī)療設(shè)備。學(xué)校成功研制出我國首個獲批上市化學(xué)發(fā)光法新冠病毒抗體檢測產(chǎn)品，現(xiàn)已獲得歐盟CE等多項認(rèn)證。科技成果轉(zhuǎn)化成效顯著，化學(xué)發(fā)光法新冠抗體檢測試劑盒、腫瘤免疫治療等科技成果高質(zhì)量完成轉(zhuǎn)化，轉(zhuǎn)化金額達(dá)2300多萬元。
學(xué)校現(xiàn)有國家級、省部級研究平臺60個。其中，國家重點(diǎn)實(shí)驗室、國家工程研究中心、國家臨床醫(yī)學(xué)研究中心、國家生物產(chǎn)業(yè)基地實(shí)驗動物中心、國家級國際科技合作基地等國家級平臺5個；教育部重點(diǎn)實(shí)驗室國際合作聯(lián)合實(shí)驗室、省部共建協(xié)同創(chuàng)新中心，以及國家衛(wèi)健委重點(diǎn)實(shí)驗室等國家部委級平臺6個；省級重點(diǎn)實(shí)驗室、工程（技術(shù)）研究中心、國際科技合作基地、臨床醫(yī)學(xué)研究中心、智庫、科普基地等省級平臺49個。另有，省級“海外高層次人才創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)基地”和“院士專家工作站”。
學(xué)校積極開展國內(nèi)外交流合作。與歐洲、亞洲、北美洲、大洋洲的23個國家和地區(qū)的53所教育或醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)建立了合作關(guān)系，其中包括美國達(dá)特茅斯學(xué)院、加拿大不列顛哥倫比亞大學(xué)、英國倫敦大學(xué)學(xué)院等國際名校；與英國萊斯特大學(xué)中外合作辦學(xué)項目已正式啟動，是我國西部地區(qū)唯一獲批的臨床醫(yī)學(xué)中外合作辦學(xué)項目，也是全國4個臨床醫(yī)學(xué)本科中外合作辦學(xué)項目之一；同時，與復(fù)旦大學(xué)、西南大學(xué)等“雙一流”建設(shè)高校開展長學(xué)制醫(yī)學(xué)生的聯(lián)合培養(yǎng)。學(xué)校現(xiàn)有直屬附屬醫(yī)院9所（綜合性醫(yī)院5所，兒童醫(yī)院、口腔醫(yī)院、康復(fù)醫(yī)院、中醫(yī)院各1所）。附屬第一醫(yī)院、附屬兒童醫(yī)院、附屬第二醫(yī)院連續(xù)9年入選“中國最佳醫(yī)院排行榜”百強(qiáng)（復(fù)旦大學(xué)醫(yī)院管理研究所發(fā)布），2019年度分別排名第56位、第58位、第98位。各直屬附屬醫(yī)院共擁有國家臨床重點(diǎn)專科28個，編制床位14100余張，年門診量近1200萬人次，年收治住院病人40余萬人次。此外，學(xué)校還有27所非直屬附屬醫(yī)院和18所教學(xué)醫(yī)院，分布在重慶、成都、西安、深圳等地。