學校肇始于1950年成立的長春市立中醫進修學校，前身是1958年成立的長春中醫學院，2006年更名為長春中醫藥大學。學校是吉林省省屬重點大學、國家中西部高校基礎能力建設工程高校、吉林省人民政府和國家中醫藥管理局共建高校、吉林省特色高水平大學建設高校。
學校始終恪守“啟古納今，厚德精術”的校訓精神，牢牢抓住立德樹人這一根本任務，形成了從本科教育到碩士、博士研究生教育，以及高職教育、繼續教育、留學生教育等多層次、多類型的人才培養格局，為國家培養了各級各類人才5萬余名，校友遍及海內外。學校突出中醫藥特色和優勢，產學研結合，不斷提高對區域經濟和社會發展的貢獻率。
學校現有全日制在校生13694人，其中本專科生10804人，研究生2679人。有博士生導師139人，碩士生導師695人。學校有院士（雙聘）1人，國醫大師3人，白求恩獎章1人，“長江學者”1人，國家973項目首席科學家1人，全國中醫藥領軍人物“岐黃學者”2人，全國百千萬人才工程1人，全國優秀教師4人，全國名中醫2人，全國中醫藥高等學校教學名師2人，享受國務院特殊津貼41人，教育部新世紀優秀人才計劃2人，全國老中醫藥專家學術經驗繼承工作指導老師25人。
學校以中醫藥學科為主，醫、工、管、法、文等學科協調發展，有一級學科博士后流動站2個，一級學科博士學位授權點2個，博士專業學位授權點1個，一級學科碩士學位授權點6個，碩士專業學位授權點5個。現有國家中醫藥管理局重點學科19個，吉林省特色高水平學科4個，省重中之重學科2個。學校設有本科專業23個，其中國家級一流專業建設點3個，國家級特色專業建設點4個，國家級專業綜合改革試點專業1個。有國家級人才培養模式創新實驗區1個。有國家級一流本科課程5門，國家級精品資源共享課2門，國家級精品課程3門，國家級虛擬仿真實驗教學項目2項，主編規劃教材58部。
學校有較強的科研實力，有國家重點研發計劃項目、“973”項目、第四次中藥資源普查項目、國家自然科學基金區域創新發展聯合基金項目、國家社會科學基金項目等重大重點科技項目58項。“十三五”期間，取得高水平科研成果512項，有國家級教學成果獎2項，吉林省教學成果特等獎1項，省科技進步一等獎5項，省社會科學優秀成果一等獎1項。現有長春國家生物產業基地醫藥中試平臺、國家中藥質量檢測技術平臺（北方）、吉林省習近平新時代中國特色社會主義思想教育研究協同創新中心等78個國家級和省部級科研平臺。
學校是教育部首批批準接收和培養外國留學生及臺港澳地區學生和中國政府獎學金來華留學生接收院校，與21個國家和地區的高校、研究單位開展廣泛的學術交流與合作。
學校建設發展得到社會各界的廣泛贊譽和各級政府的充分肯定，是國家級大學生文化素質教育基地，全國中醫藥文化宣傳教育基地，全國科普教育基地。榮獲“全國文明單位”“全國文明校園”稱號，被教育部授予“全國畢業生就業典型經驗高校”“全國創新創業典型經驗高校”。基礎醫學院榮獲“全國教育系統先進集體”稱號；附屬醫院榮獲“全國五一勞動獎狀”“全國衛生系統先進集體”“全國援外醫療工作先進集體”等稱號。
學校發揮醫學院校優勢，在新冠肺炎疫情防控中主動擔當作為。先后選派47名醫護人員組建2支中醫醫療隊，馳援武漢抗擊疫情，他們在雷神山醫院實現患者零死亡、醫護零感染、安全零事故、人員零投訴、治愈零復發的“五零”驕人成績；選派75名醫務工作者支援吉林市、舒蘭市，深入長春、農安等地開展救治，用實際行動詮釋了山水有隔、大愛無疆、大醫精誠的新時代中醫藥人的初心與使命。學校附屬醫院榮獲“全國抗擊新冠肺炎疫情先進集體”“全國先進基層黨組織”兩項稱號。
新時代，新機遇，新挑戰，學校將深入貫徹落實習近平新時代中國特色社會主義思想和黨的十九大精神，繼往開來，凝心聚力，向著一流中醫藥大學的目標邁進。