南方醫科大學南方醫院是一所集醫療、教學、科研和預防保健為一體的大型綜合性三級甲等醫院，全國百佳醫院。系南方醫科大學（原第一軍醫大學）第一附屬醫院、第一臨床醫學院。醫院創建于1941年，2004年8月隨大學由軍隊移交廣東省。南方醫院綜合排名在國內權威排行榜中穩定在15名左右，有15個專科進入中國最佳專科排行榜（復旦版）前十或得到提名，是廣東省高水平醫院“登峰計劃”首批重點建設單位和國家區域中醫（風濕病科）診療中心。

醫院現下轄院本部、增城分院、知識城分院、江高院區，太和分院、新塘醫院、泰成逸園分院。院本部坐落在廣東省廣州市白云山東麓麒麟崗上，擁有廣東省花園式院區，曾被評為“全國部門造林綠化400佳單位”。現占地面積20.3萬平方米，建筑面積45.8萬平方米；展開床位2225張，醫療設備總值近14億元；2018年門急診量325.46萬人次，年出院人數11.9萬人次。增城分院地處廣州市東部國家級增城經濟技術開發區，目前已正式開業，規劃床位1500張，致力于打造為“流程智能化、管理精細化、服務優質化“的智慧型三級甲等醫院；新塘醫院為二級綜合醫院，展開床位250張；江高院區地處廣州西北部，歷史可追溯至清末新西蘭傳教士開設的普惠醫院，院區建筑中西合璧，環境優美，為廣州市文物保護單位，現展開床位360張，開設有老年病科、介入科、精神心理科、健康管理科等。

醫院設置診療科目111個，擁有臨床醫學一級學科博士學位授權點和臨床醫學博士后流動站；內科學（消化系病）為國家重點學科，外科學（骨外）為國家重點培育學科；擁有國家臨床重點專科建設項目14個，國家中醫重點學科4個；設有器官衰竭防治省部共建國家重點實驗室、慢性腎病國家臨床醫學研究中心，國家高等院校學科創新引智基地1個，廣東省腎臟病研究所、南方消化病研究所、廣東省肝臟疾病研究所。廣東省臨床重點專科達31個，臨床醫學獲評廣東省攀峰重點學科，口腔臨床醫學獲評廣東省優勢重點學科。“器官衰竭防治研究”項目被評為廣東省211工程重點建設項目；在全國率先成立了“健康管理示范基地”、“李可中醫藥學術流派傳承基地”和“古中醫疑難雜癥治療中心”。涉外醫療中心惠僑樓創辦于1979年，先后共收治91了個國家和地區的11萬余名海外各界人士，1995年被中央軍委授予“模范醫療惠僑科”榮譽稱號，并獲江澤民主席親筆題詞嘉勉。

醫院現有專業技術人員4271人，其中高級專業技術職務603人,博士生導師118人，碩士生導師131人。有115人擔任省級以上學術團體主任委員和副主任委員職務，有28名專家享受國務院政府特殊津貼。其中包括中科院院士1人、國家“973”計劃項目首席科學家1名、國家杰出青年基金獲得者2名、“新世紀百千萬人才工程”國家級人選4名。

經過70余年的發展，醫院在消化病診治、腎病的綜合治療、血液病治療、心血管病診治、腫瘤綜合和生物治療、腎、肝及多器官聯合移植技術、神經病學與顱腦外科、顯微創傷外科、骨科技術、介入診療技術、大面積燒傷救治、重大突發事件的應急救治、整形美容、圍產醫學與輔助生殖、影像診斷、藥學等方面形成明顯的技術特色與優勢。醫院的遠程醫學會診中心可與廣東、云南、海南等省的200余家醫療衛生機構開展遠程醫學會診。

醫院每年承擔著2500余名全日制本科生和1000余名全日制研究生的管理及培養任務，是首批國家級臨床教學培訓示范中心。臨床醫學八年制專業獲教育部、衛生部卓越醫生教育培養計劃項目、廣東省專業綜合改革試點項目，醫學影像學為教育部特色專業；全國首批八年制醫學教育培養單位之一；衛生部首批專科醫師培訓基地、臨床藥師培訓基地和人類輔助生殖技術培訓基地；有國家精品課程1門、國家級特色專業3個；先后獲國家教學成果二等獎1項、廣東省教學成果一等獎1項；主編全國統編教材5部。

醫院多次獲國家“十二五”科技重大專項、國家自然科學基金廣東省聯合基金等重大課題資助；先后獲國家科技進步二等獎8項，中華醫學科技獎一等獎1項，有1人獲廣東省突出貢獻獎、1人獲“何梁何利獎”、10人獲“丁穎科技獎”；自主研發的“全氟丙烷人血白蛋白微球注射劑”取得了國家生物制品I類新藥證書；侯凡凡教授在新英格蘭醫學雜志上發表了原創性論著，影響因子達51.296。

近年來，醫院先后獲得 “全國百姓放心示范醫院”、“全國醫院文化建設先進單位”、“中國醫院管理協會科技創新獎”、“全國病歷質量評比一等獎”等榮譽稱號；連年被評為廣州市醫保AAA級單位和“廣州市醫保管理先進單位”。在抗震救災、廣州亞運等突發事件和醫療保障工作中均有出色表現，分別被中共中央、國務院、中央軍委授予“抗震救災英雄集體”稱號；被第十六屆亞運會組委會、廣州亞殘運會組委會授予“廣州市亞運會、亞殘運會組委會先進集體”稱號。南方醫院駱抗先教授先后榮獲“時代楷模”、“全國道德模范”榮譽稱號。