東北林業(yè)大學(xué)于1954年始設(shè)林學(xué)和林工研究班，標(biāo)志著研究生教育的開始。1955年設(shè)林業(yè)經(jīng)濟研究班。到1957年，共招收研究生80人。研究班均由原蘇聯(lián)專家講課，培養(yǎng)兩年制研究生。1958-1960年停止招生。1961年開始恢復(fù)招生，到1964年又招收研究生13人。1965-1977年又停止招生。1978年再次恢復(fù)招收研究生。1981年被國務(wù)院學(xué)位委員會批準(zhǔn)為首批博士、碩士授予單位。2011年11月成立研究生院。

截止到2015年7月共培養(yǎng)畢業(yè)研究生15868人，其中：授予博士學(xué)位1731人，學(xué)術(shù)型碩士學(xué)位9720人，全日制專業(yè)學(xué)位869人，非全日制專業(yè)碩士學(xué)位3534人，外籍博士3人。東北林業(yè)大學(xué)現(xiàn)有在學(xué)研究生6635人，其中：博士生939人，學(xué)術(shù)型碩士研究生2512人，全日制專業(yè)學(xué)位研究生775人，非全日制專業(yè)學(xué)位研究生2194人。

研究生院現(xiàn)設(shè)有9個科室，有管理人員17人，主要負責(zé)學(xué)位與研究生教育的管理工作。

東北林業(yè)大學(xué)是中國學(xué)位與研究生教育學(xué)會農(nóng)林學(xué)科工作委員會副主任委員單位，農(nóng)林學(xué)科工作委員會學(xué)科建設(shè)組組長單位，東北地區(qū)農(nóng)林院校研究生教育協(xié)作組組長單位，全國工程碩士專業(yè)學(xué)位林業(yè)工程領(lǐng)域組長單位，黑龍江省學(xué)位與研究生教育學(xué)會專業(yè)學(xué)位專業(yè)委員會掛靠單位。