延邊大學(xué)醫(yī)學(xué)院前身是1948年10月1日成立的延邊醫(yī)科專門學(xué)校。1949年4月成立延邊大學(xué)時(shí)，合并成為延邊大學(xué)醫(yī)學(xué)部。1958年8月從延邊大學(xué)分立為獨(dú)立的延邊醫(yī)學(xué)院。1996年，延邊地區(qū)五所高校正式合并，延邊醫(yī)學(xué)院成為延邊大學(xué)醫(yī)學(xué)院；2005年4月，成立延邊大學(xué)醫(yī)學(xué)部，下設(shè)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、臨床醫(yī)學(xué)院、中醫(yī)學(xué)院、藥學(xué)院和護(hù)理學(xué)院。2012年3月，學(xué)校根據(jù)醫(yī)學(xué)教育國(guó)際化的發(fā)展，基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院在原有規(guī)模基礎(chǔ)上，成立了新的延邊大學(xué)醫(yī)學(xué)院。于2018年根據(jù)學(xué)校總體部署與醫(yī)學(xué)教育改革發(fā)展需求，撤銷延邊大學(xué)醫(yī)學(xué)部，原醫(yī)學(xué)院、臨床學(xué)院、中醫(yī)學(xué)院合并，成立了新的延邊大學(xué)醫(yī)學(xué)院。

醫(yī)學(xué)院現(xiàn)有教職工207人，其中教授60人，副教授58人，講師35人，助教1人；實(shí)驗(yàn)技術(shù)人員16人，行政管理工作人員25人；專任教師中具有博士學(xué)位的116人，博士生導(dǎo)師17人，碩士生導(dǎo)師55人。醫(yī)學(xué)院有國(guó)務(wù)院特殊津貼”享受者2人、“吉林省省管高級(jí)專家”1人、“延邊朝鮮族自治州首屆金達(dá)萊學(xué)者”1人、“全國(guó)勞動(dòng)模范”1人、“全國(guó)五一勞動(dòng)獎(jiǎng)?wù)隆?人、“全國(guó)優(yōu)秀科技工作者”1人、“教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才”1人、“寶鋼教師獎(jiǎng)”2人、“吉林省百名高層次創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)引進(jìn)人才”1人、“吉林省新世紀(jì)科學(xué)技術(shù)優(yōu)秀人才”1人、“吉林省教學(xué)名師”2人、“省優(yōu)秀模范教師”1人、“吉林省衛(wèi)生廳有突出貢獻(xiàn)中青年專業(yè)技術(shù)人才”4人、“吉林省拔尖創(chuàng)新人才”第一層次2人、第二層次1人、第三層次3人、“長(zhǎng)白山”學(xué)者1人、延邊大學(xué)優(yōu)秀教師。

醫(yī)學(xué)院設(shè)有學(xué)院辦公室、教務(wù)辦公室、學(xué)科建設(shè)與研究生管理辦公室、學(xué)生管理辦公室，下設(shè)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)系、臨床醫(yī)學(xué)系、中醫(yī)學(xué)系，41個(gè)教研室、實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心、實(shí)訓(xùn)實(shí)驗(yàn)室，有細(xì)胞功能研究中心、腫瘤研究中心、再生醫(yī)學(xué)研究所、皮膚病與性病研究所、臨床醫(yī)學(xué)研究所。

醫(yī)學(xué)院有臨床醫(yī)學(xué)、麻醉學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、中醫(yī)學(xué)五個(gè)本科專業(yè)，其中臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)是國(guó)家級(jí)特色專業(yè)。醫(yī)學(xué)院每年新招400余名本科生，目前在校本科生為1600余名。有3個(gè)吉林省優(yōu)秀教學(xué)團(tuán)隊(duì)，1個(gè)吉林省實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心。有5個(gè)吉林省精品課程、9個(gè)吉林省優(yōu)秀課程、6個(gè)延邊大學(xué)精品課程、8個(gè)延邊大學(xué)優(yōu)秀課程。擁有18個(gè)（臨床醫(yī)學(xué)二級(jí)學(xué)科）國(guó)家教育部重點(diǎn)學(xué)科（吉林省重中之重學(xué)科），1個(gè)國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科，1個(gè)吉林省中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科，1個(gè)國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委認(rèn)證的實(shí)驗(yàn)室，1個(gè)吉林省博士后創(chuàng)新實(shí)踐基地，2個(gè)吉林省衛(wèi)生計(jì)生委重點(diǎn)專科，擁有6個(gè)臨床醫(yī)學(xué)研究室、1個(gè)醫(yī)學(xué)中心實(shí)驗(yàn)室及臨床技能培訓(xùn)中心。基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)2個(gè)博士后科研流動(dòng)站及工作站。

有2個(gè)一級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授予點(diǎn)（基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)）和7個(gè)二級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授予點(diǎn)（生理學(xué)、病理學(xué)、免疫學(xué)、人體解剖與組織胚胎學(xué)、內(nèi)科學(xué)、兒科學(xué)、皮膚病與性病學(xué)），2個(gè)一級(jí)學(xué)科和27個(gè)二級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位授予點(diǎn)。基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)一級(jí)學(xué)科為吉林省優(yōu)勢(shì)特色學(xué)科：生物學(xué)為學(xué)校“十二五”優(yōu)勢(shì)特色重點(diǎn)學(xué)科。免疫生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室為吉林省教育廳重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，中藥病理學(xué)為吉林省中醫(yī)藥管理局二級(jí)實(shí)驗(yàn)室、研究室，中韓食品科學(xué)與技術(shù)國(guó)際科技合作基地、長(zhǎng)白山特色藥材聯(lián)合研發(fā)中心。神經(jīng)生物學(xué)、神經(jīng)免疫與臨床免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)室、皮膚性病實(shí)驗(yàn)室、兒科病實(shí)驗(yàn)室、消化系病實(shí)驗(yàn)室為吉林省衛(wèi)生與健康管理委員會(huì)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。每年新招近250名碩士研究生和近30名博士研究生，目前在校博士研究生為93人、碩士研究生為643人。

醫(yī)學(xué)院積極開(kāi)展國(guó)際間的交流與合作，與日本城西大學(xué)等23所國(guó)外大學(xué)、研究機(jī)構(gòu)及醫(yī)院建立了友好協(xié)作關(guān)系，有計(jì)劃的派選教師到國(guó)外大學(xué)、研究機(jī)構(gòu)及醫(yī)院交流學(xué)習(xí)或攻讀學(xué)位。

2005年成立延平司法鑒定所，獨(dú)立法人、獨(dú)立核算、自負(fù)盈虧單位。鑒定類別為法醫(yī)病理、法醫(yī)臨床、法醫(yī)物證，主要鑒定業(yè)務(wù)為：損傷鑒定（損傷程度鑒定、傷殘等級(jí)鑒定、誤工-護(hù)理-營(yíng)養(yǎng)期鑒定、醫(yī)療損害鑒定、保外就醫(yī)鑒定等）、死因鑒定、親子鑒定等。年業(yè)務(wù)量為（2017年度）：總1082例，其中法醫(yī)臨床案968例（89%），法醫(yī)病理案39例（4%），法醫(yī)物證案75例（7%）。

2007年成立了延邊大學(xué)醫(yī)學(xué)院遺體捐獻(xiàn)接受中心，為全州遺體捐獻(xiàn)工作服務(wù)，負(fù)責(zé)全州捐獻(xiàn)志愿者遺體的接收、運(yùn)輸和殯葬等工作。2013年1月1日至2017年12月31日，已辦理登記遺體捐獻(xiàn)者近120人，已成功接受49例遺體捐獻(xiàn)。此外，這期間收集無(wú)名尸體173具，主要用于醫(yī)學(xué)教育的正常教學(xué)和科研方面。