錦州醫科大學研究生教育工作始于1979年，先與中國醫科大學聯合培養碩士研究生，1984年成為全國第二批擁有碩士學位授予權的高等院校之一，1999年獲得具有同等學力人員申請碩士學位授予權資格，2003年經教育部批準開始與中國醫科大學聯合培養博士研究生。三十多年來，在上級領導的大力支持和學校黨委的正確領導下，在學校各部門的支持配合下，經過全體研究生指導教師和研究生管理工作人員的辛勤努力，錦醫的研究生教育工作取得長足進步，教育規模逐步擴大，教育水平不斷提高。

現有基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、藥學、公共衛生與預防醫學、護理學、生物學和食品科學與工程一級學科碩士學位授權點8個；二級學科碩士學位授權點58個；臨床醫學、藥學、護理、獸醫和農學專業學位授予點5個；聯辦博士點4個。形成以醫學為主體的圍繞醫學各領域理學、工學、法學、哲學、農學各學科全方位協調發展的學科體系。現有在校研究生2600余人，碩士研究生指導教師1600余名，博士研究生指導教師29人。

招生方面，錦州醫科大學統招研究生招生規模逐年擴大，2020年在教育部大幅增加碩士研究生招生計劃，向服務國家戰略和社會民生急需的領域傾斜的政策背景下，最終擬錄取1000人，較2019年增加169人，增長率達20%。其中學術學位332人，較2019年增加49人，增長率17%；專業學位668人，較2019年增加120人，增長率22%。同等學力研究生招生在在職人員提高學歷的迫切去求下，招生規模穩定增長，生源質量逐年提高，2019級共招生588人。

在基地建設方面，有錦州醫科大學附屬第一醫院、附屬第二醫院（口腔醫學院）和附屬第三醫院三所直屬附屬醫院；有中國人民解放軍北部戰區總醫院、中國人民解放軍聯勤保障部隊第九六零醫院、臨沂市人民醫院等30余家校外臨床醫學碩士專業學位研究生培養基地；有中國人民解放軍總醫院第三醫學中心、中國人民解放軍總醫院第四醫學中心、中國人民解放軍火箭軍總醫院、上海市奉賢區中心醫院、上海市東方醫院、生態環境部華南科學研究所等多家校外學術型研究生培養基地；有大連潤生康泰醫學實驗室有限公司、大連三儀動物藥品有限公司、遼寧益康生物股份有限公司等多家校外非臨床醫學碩士專業學位研究生培養基地。

錦州醫科大學研究生培養本著教書育人的理念，注重研究生思想道德培養和個人能力培養，切實加強導師隊伍建設及導師對研究生培養的引領作用。導師隊伍中有“長江學者獎勵計劃”特聘教授2人，國家教學名師獎獲得者1人，新世紀百千萬人才工程國家級人選1人，遼寧省優秀專家3人，“遼寧省高等學校攀登學者支持計劃”入選者4人，遼寧特聘教授14人遼寧省中青年學科帶頭2人、遼寧省“百千萬人才工程”人選43人。現有遼寧省重點實驗室13個，高校重大科技平臺2個，專業技術創新中心2個，工程研究中心1個，臨床醫學研究中心2個。遼寧省重點學科8個。

錦州醫科大學關心學生全面健康發展。抓好學生黨支部建設，采取科學有效的學生管理模式，開展豐富多彩的學生課余活動，促進學生全面健康發展。隨著研究生培養質量的逐步提高，畢業生總體素質也在提升，在全國各省地級醫療衛生單位和企事業單位就業后，受到了用人單位的好評。盡管每年的就業形勢不同，畢業生就業壓力逐年增加，但是我院畢業生仍然保持著良好的就業前景。

在未來，錦州醫科大學學位與研究生教育將以習近平新時代中國特色社會主義為指導，全面貫徹黨的教育方針，堅定走內涵式發展道路，以立德樹人，服務需求，提高質量為主線，繼承“勤儉攻堅”的錦醫精神，根據社會發展和現代化建設對高層次人才培養的需要，規劃研究生教育發展的宏偉藍圖，為遼西地區醫療及相關事業發展，為國家醫藥衛生及教育事業發展培養和造就更多優秀的全面發展、素質過硬且具有創新才能的醫學專業人才。