安徽中醫藥大學學位與研究生教育起步于上世紀70年代，1978開始招收碩士研究生，1981年首批獲碩士學位授權，1999年開始聯合培養博士研究生，2008年獲得開展碩士研究生推薦免試資格，2009年被批準為國家級新增博士學位授權立項建設單位，2013年獲博士學位授權，2014年開始招收博士研究生。2016年更名為研究生院，下設綜合科、招生辦、培養科、學位科和學籍科共5個科室，負責全校的學位點建設和研究生教育工作。

安徽中醫藥大學研究生院工作職責和業務范圍

研究生院在學校黨委、行政的領導下，負責全校的學位與研究生教育管理工作，其主要職責有：

1.根據國家學位與研究生教育相關規劃，結合學校實際情況，制定研究生教育發展規劃以及研究生招生、培養、學位授予等工作細則和各項規章制度。

2.制定年度招生計劃，以及各級各類研究生招生錄取等各項工作。

3.組織制訂研究生培養方案和教學計劃，組織做好各學科、專業研究生課程建設和教學管理、學位論文工作；做好研究生學籍管理和培養環節的督導工作。

4. 組織安排學位申請人的學位課程考試、學位論文評閱及答辯、學位論文的抽查和評估；負責導師隊伍建設和管理。

5. 負責研究生學籍管理，組織研究生開展社會實踐和學術、科技、文化活動。