海洋環境與工程學院，是上海海事大學航運、物流、海洋三大學科群中的海洋類支柱學院。為“一帶一路”“海洋強國”國家戰略培養高級海洋專業人才，提供海洋科技支撐。

科研系列設1院4所2室21中心：海洋材料科學與工程研究院、船舶與海洋工程研究所、安全科學與工程研究所、航運環境保護研究所、港口航道與海洋工程研究所，上海市高校重點實驗室“深海極端環境服役材料實驗室”、寶鋼股份“海洋極端環境鋼鐵材料制備與蝕損控制聯合實驗室”，以及上海市海洋局深海裝備材料與防護工程技術研究中心等21個科研中心。

學位點系列設：3個二級學科博士點（海洋運輸工程材料與防護、海岸與海洋工程管理、交通運輸安全與環境工程）；1個一級學科碩士點“水利工程”，1個工程碩士點（水利工程領域）；6個二級學科碩士點：海洋運輸工程材料與防護，交通運輸安全與環境工程，港口、海岸及近海工程，水工結構工程，水文學與水資源，海岸與海洋工程管理。

海洋環境與工程學院現有教職工123人：專任教師96人（教授17人，副教授25人，博士學位94%），實驗教師16人、思政教師7人、行政管理人員4人。有教育部長江學者特聘教授1人、國務院特殊津貼專家1人、上海市領軍人才1人，教育部新世紀優秀人才1人、上海市優秀技術帶頭人1人、上海市教學名師1人，曙光學者1人、晨光學者5人、交通青年科技英才2人、青年東方學者2人。海洋環境與工程學院現有在校生1548人（本科生1302人，各類研究生161人）。

海洋環境與工程學院現有14700平方米的教學、科研與實驗用房，近年投入資金7000余萬元。擁有環境工程原理實驗室、水污染控制工程實驗室、環境化學實驗室、環境監測實驗室、紫外線儀器實驗室等；安全監測技術實驗室、船舶火災安全工程實驗室、燃燒學實驗室、安全人機工程實驗室、通風安全工程實驗室、船舶清潔高效滅火實驗室；土力學實驗室、水力學實驗室、工程地質與水文實驗室、建筑材料實驗室；透射電鏡室、透射掃描水循環實驗室、金相制樣室、掃描電鏡室、力學性能實驗室、深海極端環境模擬實驗室、海洋材料腐蝕與防護研究室、海洋功能材料研究室、海洋生物與藥物研究室、材料成型與加工研究室、材料表面工程與技術研究室、核磁共振室、微生物培養與分析室、熱分析室、光譜分析室、X射線衍射分析室等一批國際先進水平實驗室。

海洋環境與工程學院主要研究領域有：海洋極端環境鋼鐵材料制備與蝕損控制、海洋材料微生物附著機制及防污技術、高技術船舶設計與制造、海洋結構物設計建造及性能評估、船舶與海洋結構物水動力性能、海洋運輸安全與公共安全工程、火災爆炸和危化品安全、船舶及港口防污染技術、近海海域環境污染控制技術、海岸與深海水動力、港口與海岸工程技術等，其中深海材料研究達國際先進水平。