新疆大學(xué)從1978年起開始培養(yǎng)研究生，1981年經(jīng)國務(wù)院批準成為首批具有碩士學(xué)位授予權(quán)的高校，1996年又獲得博士學(xué)位授予權(quán)。現(xiàn)有8個博士一級學(xué)科，47個博士二級學(xué)科點，9個博士后科研流動站，29個碩士一級學(xué)科，154個碩士二級學(xué)科點，8個專業(yè)碩士學(xué)位點；國家級重點學(xué)科2個、國家級重點（培育）學(xué)科1個，自治區(qū)級重點學(xué)科18個（其中自治區(qū)級重點培育學(xué)科2個），校級重點學(xué)科24個；自治區(qū)產(chǎn)學(xué)研聯(lián)合培養(yǎng)研究生示范基地29個。學(xué)科、學(xué)位點數(shù)量處于區(qū)內(nèi)高校首位，有哲學(xué)、經(jīng)濟學(xué)、法學(xué)、文學(xué)、歷史學(xué)、理學(xué)、工學(xué)、管理學(xué)八個學(xué)科門類，涵蓋了高層次人才培養(yǎng)和科學(xué)研究的主要領(lǐng)域。

新疆大學(xué)擁有一支結(jié)構(gòu)合理、素質(zhì)優(yōu)良、充滿活力、可持續(xù)發(fā)展的導(dǎo)師隊伍。學(xué)科、學(xué)位點中具有博士學(xué)歷的教師比例明顯提高，學(xué)科梯隊建設(shè)初見成效，通過重點崗位聘任、人才引進以及選送青年教師到知名高校進修、訪學(xué)、攻讀學(xué)位，聘請國內(nèi)外知名大學(xué)教授作兼職教授等措施，使各學(xué)科形成了一支由重點學(xué)科帶頭人、方向帶頭人、青年學(xué)術(shù)骨干組成的結(jié)構(gòu)合理、高效精干的學(xué)科梯隊，產(chǎn)生了學(xué)科建設(shè)的主體，使學(xué)科隊伍學(xué)歷、職稱、年齡層次結(jié)構(gòu)更加合理。現(xiàn)有博士生導(dǎo)師104人，碩士生導(dǎo)師603人，其中外聘導(dǎo)師120人。

截止2013年9月，研究生在校規(guī)模達到4978人，其中博士生333人， 碩士生4042人，專業(yè)學(xué)位研究生603人。在研究生招生規(guī)模大幅增加的同時，新疆大學(xué)始終把研究生的培養(yǎng)質(zhì)量放在第一位，把研究生創(chuàng)新能力的培養(yǎng)和素質(zhì)培養(yǎng)放在突出的位置。2008年學(xué)校開展研究生培養(yǎng)機制改革，推行以科學(xué)研究為主導(dǎo)的導(dǎo)師負責(zé)制和以科研經(jīng)費為引導(dǎo)的導(dǎo)師資助制，建立以獎學(xué)金為核心的動態(tài)研究生獎助體系，形成了科學(xué)合理的研究生招生指標配置機制，逐步完善碩士生培養(yǎng)過程的質(zhì)量監(jiān)控和評估等措施。堅持每學(xué)期分階段進行教學(xué)質(zhì)量檢查，注重考風(fēng)、考紀建設(shè)，對違背學(xué)術(shù)道德等現(xiàn)象及時處理。在全校倡導(dǎo)一種不唯名、不唯利、不唯書、不唯上的良好學(xué)風(fēng)，努力造就具有新疆大學(xué)特色的學(xué)術(shù)精神。

新疆大學(xué)培養(yǎng)的研究生因基礎(chǔ)知識扎實，知識結(jié)構(gòu)合理，具有較強的前沿意識、良好的專業(yè)特色和發(fā)展個性、吃苦耐勞和踏實肯干的作風(fēng)，而受到用人單位的普遍贊譽。新疆大學(xué)已成為自治區(qū)高層次人才培養(yǎng)、科學(xué)技術(shù)研究的重要基地。

面對新世紀科學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展和知識經(jīng)濟時代所帶來的機遇與挑戰(zhàn)，新疆大學(xué)學(xué)位與研究生教育將繼續(xù)以培養(yǎng)具有創(chuàng)造能力和專門精英人才為工作目標，充分發(fā)揮自身的辦學(xué)優(yōu)勢和特色，面向市場、面向社會，努力加強學(xué)科建設(shè)，不斷優(yōu)化結(jié)構(gòu)，深化教育改革，提高培養(yǎng)質(zhì)量，樹立新疆大學(xué)研究生教育培養(yǎng)的品牌，為把我校建設(shè)成為“西部先進，中亞一流，國際知名”的高水平大學(xué)的目標而奮斗。