1997年，福建農業大學依托生物技術研究中心建設“國家理科基礎科學研究與教學人才培養基地”并招收理科（生物學本科專業）基地班學生，為了建設理學學科，2001年4月，福建農林大學整合了植物學、微生物學、化學等教學、科研單位的優勢資源成立了福建農林大學生命科學學院，15年的勵精圖治與艱苦創業，福建農林大學秉承“明德、誠智、博學、創新”校訓和 “學術立院、人才強院、文化興院、特色名院”的建院理念，大力弘揚“追求卓越、追求完美、追求和諧”學院文化，以高水平大學建設為引領，以拔尖創新人才培養為中心，以學科和師資建設為重點，加快高水平生態學和生物學學科建設，使福建農林大學發展成為學科優勢明顯、特色鮮明的生命科學研究和人才培養基地。

福建農林大學現有教職工203人(含菌草所)，86.7%具有博碩士學位，其中教授28人，副教授39人，博士生導師26人，碩士生導師47人，有聯合國國際生態安全科學院院士1人，國家級特殊貢獻專家2人，國務院政府特殊津貼專家8人，國家“百千萬人才工程”一、二層次人選和國家“新世紀百千萬人才工程”人選3人，全國優秀教師1人，國家自然科學基金優秀青年基金獲得者2人，教育部新世紀優秀人才2人，教育部優秀骨干教師1人，全國農技推廣標兵1人，省杰出科技人員2人，省“百人計劃”2人，閩江學者特聘教授3人，講座教授5人，省“百千萬人才工程”人選、“新世紀百千萬人才工程”、“省青年拔尖人才”等省級人選6人。

福建農林大學擁有生物學和生態學2個一級學科博士點和博士后流動站；有生物學和生態學2個省級重點學科和省級特色重點學科。福建農林大學設有生物科學、生物技術、生物工程、生物信息、化學生物、應用化學六個系。有國家生物學理科基地班、生物科學、生物技術、生物工程、生物信息學、應用化學等六個本科專業，其中生物科學為國家特色專業、生物技術為省特色專業。在讀本科生1162人、碩士研究生334人、博士研究生105人，博士后34人。另有來自18個國家的外國留學生62人。

福建農林大學生態學課程被評為國家級精品課程、國家精品資源共享課程、國家精品視頻課程，有11門省級精品課程。設有生物學、生態學、化學等3個省級實驗教學示范中心，20多個政府和企業共建的校外實習單位，有2個省級優秀教學團隊，2個省級人才培養創新實驗區。

福建農林大學注重學生創新能力的培養，在歷屆全國“挑戰杯”大學生課外學術科技作品競賽中，共獲得26個獎項，其中特等獎1項，一等獎6項，二等獎10項，三等獎10項。

福建農林大學科研工作跨越式發展，近五年承擔國家級和部省級科研項目250多項，總經費達到13990萬元，獲國家科學技術進步二等獎1項、省科學技術進步一等獎3項、二等獎5項、三等獎8項。發表學術論文600篇（其中SCI、EI收錄300篇），授權專利30項，出版專著、教材22多部，新品種、新產品認定10余項。

福建農林大學擁有國家菌草工程技術研究中心、菌草綜合開發利用技術國家地方聯合工程研究中心（國家發改委）、生物農藥與化學生物學教育部重點實驗室，國家食用菌品種改良中心福建省分中心、福建省農業生態過程與安全監控重點實驗室、海峽西岸作物生態與分子生理學重點實驗室、福建省病原真菌與真菌毒素重點實驗室。

依托福建農林大學與福建省古田縣人民政府共建的福建農林大學古田菌業研究院為食用菌產業的發展做出突出貢獻。林占熺教授發明的菌草技術在技術推廣和技術援外工作取得重大的經濟和社會效益，做出杰出貢獻，所在黨支部被授予全國先進基層黨組織。

福建農林大學十分重視對外交流與合作，先后與德國BSK國際教育機構（德國大學聯盟）、香港中文大學生命科學學院、臺灣大學生命科學學院等簽訂合作協議，開展本科生專業學習與交流，選送優秀本科生到德國、美國、加拿大等攻讀研究生。一批優秀畢業生考取國內外知名大學攻讀碩士。

福建農林大學正以嶄新的姿態、飽滿的激情和昂揚的斗志，搶抓機遇，繼續弘揚“追求卓越、追求完美、追求和諧”為辦學理念，孜孜渴求、團結協作，努力建設具有鮮明閩臺區域特色的高水平教學研究型大學。