新疆大學從1978年起開始培養(yǎng)研究生，1981年經(jīng)國務院批準成為首批具有碩士學位授予權(quán)的高校，1996年又獲得博士學位授予權(quán)。現(xiàn)有8個博士一級學科，47個博士二級學科點，9個博士后科研流動站，29個碩士一級學科，154個碩士二級學科點，8個專業(yè)碩士學位點；國家級重點學科2個、國家級重點（培育）學科1個，自治區(qū)級重點學科18個（其中自治區(qū)級重點培育學科2個），校級重點學科24個；自治區(qū)產(chǎn)學研聯(lián)合培養(yǎng)研究生示范基地29個。學科、學位點數(shù)量處于區(qū)內(nèi)高校首位，有哲學、經(jīng)濟學、法學、文學、歷史學、理學、工學、管理學八個學科門類，涵蓋了高層次人才培養(yǎng)和科學研究的主要領域。

新疆大學擁有一支結(jié)構(gòu)合理、素質(zhì)優(yōu)良、充滿活力、可持續(xù)發(fā)展的導師隊伍。學科、學位點中具有博士學歷的教師比例明顯提高，學科梯隊建設初見成效，通過重點崗位聘任、人才引進以及選送青年教師到知名高校進修、訪學、攻讀學位，聘請國內(nèi)外知名大學教授作兼職教授等措施，使各學科形成了一支由重點學科帶頭人、方向帶頭人、青年學術(shù)骨干組成的結(jié)構(gòu)合理、高效精干的學科梯隊，產(chǎn)生了學科建設的主體，使學科隊伍學歷、職稱、年齡層次結(jié)構(gòu)更加合理。現(xiàn)有博士生導師104人，碩士生導師603人，其中外聘導師120人。

截止2013年9月，研究生在校規(guī)模達到4978人，其中博士生333人， 碩士生4042人，專業(yè)學位研究生603人。在研究生招生規(guī)模大幅增加的同時，新疆大學始終把研究生的培養(yǎng)質(zhì)量放在第一位，把研究生創(chuàng)新能力的培養(yǎng)和素質(zhì)培養(yǎng)放在突出的位置。2008年學校開展研究生培養(yǎng)機制改革，推行以科學研究為主導的導師負責制和以科研經(jīng)費為引導的導師資助制，建立以獎學金為核心的動態(tài)研究生獎助體系，形成了科學合理的研究生招生指標配置機制，逐步完善碩士生培養(yǎng)過程的質(zhì)量監(jiān)控和評估等措施。堅持每學期分階段進行教學質(zhì)量檢查，注重考風、考紀建設，對違背學術(shù)道德等現(xiàn)象及時處理。在全校倡導一種不唯名、不唯利、不唯書、不唯上的良好學風，努力造就具有新疆大學特色的學術(shù)精神。

新疆大學培養(yǎng)的研究生因基礎知識扎實，知識結(jié)構(gòu)合理，具有較強的前沿意識、良好的專業(yè)特色和發(fā)展個性、吃苦耐勞和踏實肯干的作風，而受到用人單位的普遍贊譽。新疆大學已成為自治區(qū)高層次人才培養(yǎng)、科學技術(shù)研究的重要基地。

面對新世紀科學技術(shù)的迅猛發(fā)展和知識經(jīng)濟時代所帶來的機遇與挑戰(zhàn)，新疆大學學位與研究生教育將繼續(xù)以培養(yǎng)具有創(chuàng)造能力和專門精英人才為工作目標，充分發(fā)揮自身的辦學優(yōu)勢和特色，面向市場、面向社會，努力加強學科建設，不斷優(yōu)化結(jié)構(gòu)，深化教育改革，提高培養(yǎng)質(zhì)量，樹立新疆大學研究生教育培養(yǎng)的品牌，為把我校建設成為“西部先進，中亞一流，國際知名”的高水平大學的目標而奮斗。