吉林大學研究生院建于1984年6月，是經國務院批準的全國22所重點大學首批試辦的研究生院之一。
1996年3月，經原國家教委批準又成為首批正式建院的研究生院之一。 吉林大學研究生教育起步較早，1949年開始招收研究生班，1952年開始招收三年制研究生，1978年開始培養學位研究生。
根據國務院關于高教管理體制改革和布局結構調整的決定，經教育部批準，2000年6月12日，分別隸屬教育部、衛生部、國土資源部、信息產業部的吉林大學、吉林工業大學、白求恩醫科大學、長春科技大學、長春郵電學院5所高校合并組建新的吉林大學。2004年原解放軍軍需大學并入吉林大學。新組建的吉林大學，學位與研究生教育的學科門類更加齊全，覆蓋了哲學、經濟學、法學、文學、教育學、歷史學、理學、工學、醫學、農學、管理學、藝術學全部十二大學科門類。吉林大學現有一級學科博士學位授權點44個，一級學科碩士學位授權點56個，各類專業學位授權點26個。有一級學科國家重點學科4個（覆蓋17個二級學科），二級學科國家重點學科15 個，國家重點（培育）學科4個。中國科學院和中國工程院院士37人（雙聘27人），國務院學位委員會學科評議組成員18人，博士生導師1213人；在校博士生、碩士生2.4萬余人。常務副校長陳崗兼任研究生院院長，崔田任常務副院長，王劍、張宗弢、黃忠民、禹平任副院長，白大范任研究生工作部部長；下設學位辦公室、研究生培養辦公室、研究生綜合辦公室、研究生管理辦公室。
多年來，吉林大學始終堅持以主動滿足社會需求為導向，以提高人才培養質量為核心，著力培養研究生創新能力、實踐能力和國際交流能力。通過強化培養過程管理，加強質量保證與監督體系建設，加強科學道德與學風教育。努力培養德智體美全面發展的高層次拔尖創新人才。初步形成了較為完善的高層次人才培養體系。目前，吉林大學研究生院已經成為學科門類齊全、培養質量較高的我國重要的研究生培養基地，為國家培養和輸送了大批優秀人才。
吉林大學地處吉林省省會長春市。長春素以街道寬闊、樹木繁茂、空氣清新而著稱。一座座高大的建筑物襯托在莽莽林海中，被譽為"森林城市"。夏天，柳暗花明，氣候涼爽宜人；冬天，玉樹銀花，景象奇妙動人，而室內有采暖設備溫暖如春。因此，無論是陽春、盛夏、金秋、寒冬，長春都是讀書學習、科學研究的好地方。