安徽工業大學學位與研究生教育起始于1980年初，1990年獲得碩士學位授予權。目前有13個一級學科碩士點，5個大類18個專業碩士點，2個一級學科博士點，1個博士后科研流動站。

設有冶金工程學院、材料科學與工程學院、化學與化工學院、機械工程學院、電氣與信息工程學院、計算機科學與技術學院、建筑工程學院、能源與環境學院、管理科學與工程學院、商學院（商學院專業學位教育中心）、公共管理與法學院、數理科學與工程學院、藝術與設計學院、馬克思主義學院、外國語學院、冶金減排與資源綜合利用教育部重點實驗室、分子工程與應用化學研究所和工程研究院等18個研究生教育培養單位。

安徽工業大學研究生教育以提高質量為核心，不斷深化研究生教育改革。建立招生計劃動態調整機制、學位點自我評估和調整機制；創新研究生培養過程管理和教育監管模式；健全質量保證與監督體系，構建科學的研究生分類分層培養體系，建立分流與淘汰機制，分類構建學術型、專業學位研究生質量標準；不斷完善導師責權制度、導師項目資助制度和研究生獎助體系和學風建設；深化研究生教育的開放、合作與交流。