微生物技術國家重點實驗室（研究院）堅持面向國家重大戰略需求，以科技創新為己任，篳路藍縷、銳意進取。經過三十年的發展，重點實驗室（研究院）已建設成為國際領先的微生物技術研究平臺和科技交流合作基地，促進了微生物學科發展，對國內外的相關研究領域起到了很好的引領作用。

微生物技術是現代生物改造及綠色生物制造產業的技術關鍵和內容核心，是生命科學和生物技術發展的重要基礎和先導，在生物科學基礎研究和生物制造產業之間扮演著承上啟下的角色，在解決人類社會所面臨的資源緊缺、環境污染、糧食危機、生態破壞等嚴峻挑戰方面，微生物技術具有無可替代的重要作用。重點實驗室(研究院）以微生物技術的發展與創新為核心，圍繞資源與環境微生物技術、醫藥微生物技術、工業微生物技術、海洋微生物技術四個研究方向進行整體布局。通過發展細菌、酵母菌和絲狀真菌等重要模式微生物的遺傳操作系統，在闡明微生物遺傳及其代謝生理的機制基礎，挖掘微生物的功能潛力，拓展微生物技術應用的研究中，致力于完善和創新微生物技術體系平臺，并為生物制造創造生物新機能、挖掘新菌種、開發新工藝和新產品。同時，通過國際、國內以及室內的協同合作，推動技術的發展與創新。

近四年，重點實驗室（研究院）共承擔各科研類項目360項，各類科研項目實到經費21066.53萬元。授權國際和國內發明專利69項。發表SCI論文557篇，論文數量、影響因子及他引次數都有了大幅度的提高。多項成果發表在Nature Nanotechnology、Cell 、PNAS等著名刊物上，顯示了重點實驗室（研究院）的研究水平有了實質性的提升，主流研究成果已居于世界先進或領先行列。另外還主編或者參編專著譯著13部。

以973首席專家曲音波教授為第一完成人的“玉米芯廢渣制備纖維素乙醇技術與應用”獲得國家技術發明二等獎。該項目不但突破了諸多技術瓶頸，填補了國內空白，并且率先在國際上建成了用玉米芯年產3000噸纖維素乙醇的中試生產裝置和萬噸級的生產示范裝置，達到國際領先水平。

作為國家重點實驗室，我們以國家需求和社會發展為指導，長期堅持并積極拓展關系到社會可持續發展的戰略性微生物技術的應用基礎研究，保持了在這些領域的國內領先地位，其中部分成果（如纖維素降解機理、木質纖維素生物煉制技術、專性自養嗜酸菌遺傳操作技術、粘細菌資源多樣性及復雜群體行為的適應進化機制、蛋白酶的適冷和海洋氮代謝機制、硫氮雜環類污染物的降解和資源化利用等）達到國際先進或領先水平，在國際同行中擁有良好的聲譽，形成了重要的國際影響。同時，通過引進和發展，實現研究方向和技術與國際前沿的接軌，如引進Red/ET系統的發明人張友明教授后我們在DNA大片段的遺傳操作技術和一步化實現基因組整合等方面達到了國際領先水平。