湖南農業大學工學院溯源于1958年開設的農業機械化專業，1961年成立農業機械化系，此后為適應學科發展，更名為農業工程系。1994年與食品科技系組建成立工程技術學院，2005年12月經學校批準改名為工學院。

經過60年的努力，工學院已經由過去單一的本科層次，發展到擁有本科、碩士、博士等多種辦學層次，并形成以農業工程為核心，融機械、自動化、汽車、水利與管理、土木建筑諸學科為一體的復合型學科群。擁有農業工程一級學科博士點，農業工程一級學科碩士學位點以及專業學位授權領域，有農業機械化及其自動化、機械設計制造及其自動化、水利水電工程、工程管理、土木工程、車輛工程、汽車服務工程和機械電子工程8個全日制本科專業。

工學院有南方糧油作物協同創新中心多熟制機械化生產配套技術與裝備研制創新平臺，是國家農業裝備技術創新戰略聯盟成員單位、農業航空產業技術創新戰略聯盟理事單位；現有湖南省現代農業裝備工程技術研究中心、智能農機裝備湖南省重點實驗室、湖南省現代食品工程技術與裝備創新中心3個省級科研平臺；有農業機械工程實訓中心、汽車工程實訓中心、水土工程實驗教學中心、機電工程實驗教學中心、金工實習廠、東方駕校等6個校級教學實踐實習基地；擁有湖南省普通高等學校機械基礎實驗教學中心、湖南省南方農業機械化生產虛擬仿真實驗教學中心2個省級實驗教學中心。

工學院共有教職工109人，專任教師78人，教授12人，副教授30人，教師中具有碩士、博士學位者66人，碩導、博導39人，省、校級骨干教師7人，各類學會理事、委員、學報編委等48人次。

六十年來，工學院畢業學生近8000人，先后培養了肖雅瑜、謝國華、唐岳、文樹勛、劉若橋、曾寶成、李波勇、顏國正等一大批優秀學子，為湖南乃至南方區域經濟發展做出了較大貢獻。