中國中醫(yī)科學院的歷史可以追溯到1973年。當時經全國著名中醫(yī)學家岳美中教授的積極申請創(chuàng)建了全國中醫(yī)研究班。1978年舉辦了全國首屆中醫(yī)研究生班。1984年正式成立研究生部。2005年，經國家中醫(yī)藥管理局批準成為中醫(yī)藥行業(yè)第一所研究生院。

作為培養(yǎng)高層次中醫(yī)藥人才的重要基地，中國中醫(yī)科學院現有中醫(yī)學、中藥學、中西醫(yī)結合三個一級學科所涵蓋的所有學科專業(yè)的博士、碩士授予權，具有臨床醫(yī)學專業(yè)學位授予權和在職人員申請學位的資質；設有中西醫(yī)結合、中醫(yī)學、中藥學三個一級學科的博士后工作站。

多年來，中國中醫(yī)科學院在“系統(tǒng)學習，全面掌握，整理提高”方針指引下，充分發(fā)揮中國中醫(yī)科學院高水平專家云集、科研項目充足、指導教師眾多的優(yōu)勢，積極開展教育教學改革，著重加強課程體系建設和教學質量的提高，著力培養(yǎng)研究生的創(chuàng)新精神和實踐能力。

到2008年，以全國首屆中醫(yī)研究生班為起點的中醫(yī)藥學位與研究生教育，迎來三十華誕。三十年來，研究生院共培養(yǎng)了28屆畢業(yè)生，為全國和世界各地輸送了眾多的優(yōu)秀人才。其中大多數已經成為國內外中醫(yī)藥機構的學科帶頭人和學術骨干。