化工學(xué)院基于1964年成立的化工系，1998年7月3日由化工與生化工程系、應(yīng)用化學(xué)系和材料物理化學(xué)研究所合并成立化工學(xué)院，2000年9月8日原化工學(xué)院更名為材料科學(xué)與工程學(xué)院，2008年6月16日由化工與制藥工程系、生物工程與技術(shù)系和環(huán)境科學(xué)與工程系成立新的化工學(xué)院。現(xiàn)下設(shè)化工與制藥工程系、生物工程與技術(shù)系、環(huán)境科學(xué)與工程系和園藝系。

目前化工學(xué)院擁有一個(gè)國(guó)家一級(jí)博士授權(quán)點(diǎn)：化學(xué)工程與技術(shù)（下設(shè)生物化工、生物材料化工、化學(xué)工程與工藝及環(huán)境化工四個(gè)博士研究方向；化學(xué)工程、化學(xué)工藝、生物化工、應(yīng)用化學(xué)、工業(yè)催化、制藥工程六個(gè)碩士研究方向）；一級(jí)學(xué)科博士后流動(dòng)站：化學(xué)工程與技術(shù)；一個(gè)一級(jí)碩士授權(quán)點(diǎn)：環(huán)境科學(xué)與工程（下設(shè)環(huán)境監(jiān)測(cè)與評(píng)價(jià)、水處理工程、大氣污染控制工程三個(gè)研究方向）；二個(gè)二級(jí)碩士點(diǎn)：生物化學(xué)與分子生物學(xué)、微生物學(xué)；一個(gè)國(guó)務(wù)院僑辦重點(diǎn)學(xué)科：生物化工。一個(gè)工程碩士領(lǐng)域：化學(xué)工程。八個(gè)本科專業(yè)：化學(xué)工程與工藝、制藥工程、生物工程、生物技術(shù)、園藝、環(huán)境工程、環(huán)境科學(xué)、環(huán)境生態(tài)工程。化學(xué)工程與技術(shù)一級(jí)學(xué)科是福建省特色重點(diǎn)學(xué)科和福建省重點(diǎn)學(xué)科，環(huán)境工程專業(yè)為福建省高等學(xué)校服務(wù)產(chǎn)業(yè)特色專業(yè)。

化工學(xué)院擁有福建省生物化工技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、化學(xué)生物學(xué)與分子工程福建省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、福建省工業(yè)廢水生化處理工程技術(shù)研究中心、廈門(mén)市海洋生物資源綜合利用工程技術(shù)研究中心、省級(jí)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心“基礎(chǔ)化學(xué)化工實(shí)驗(yàn)中心”以及“新一代物質(zhì)轉(zhuǎn)化研究所”等10個(gè)校、院級(jí)研究機(jī)構(gòu)。

化工學(xué)院匯聚了一批學(xué)緣結(jié)構(gòu)合理、教學(xué)經(jīng)驗(yàn)豐富、具有科研潛力的教學(xué)科研人員，現(xiàn)有教職工117人，其中專任教師93人，教授23人，副教授26人，博士生導(dǎo)師13人。擁有一批具有較高學(xué)術(shù)聲譽(yù)的領(lǐng)軍人才，其中雙聘院士2人，教育部“新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計(jì)劃”1人，福建省“百人計(jì)劃”2人，福建省“外專百人計(jì)劃”2人，國(guó)家高端外國(guó)專家1人，廈門(mén)市雙百計(jì)劃1人。

化工學(xué)院面向全國(guó)和境外招生，面向境內(nèi)通過(guò)全國(guó)高考本科一批或提前批招生，面向境外通過(guò)兩校(與暨南大學(xué))聯(lián)招、參加教育部的全國(guó)聯(lián)招或單獨(dú)招生。目前全日制在校生約1600人，其中本科生約1400人，碩士生約200人，博士生29人。

化工學(xué)院緊密結(jié)合國(guó)家和海峽西岸經(jīng)濟(jì)區(qū)經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展的重大需求開(kāi)展創(chuàng)新研究，成果顯著，5年來(lái)共承擔(dān)了國(guó)家自然科學(xué)基金海峽聯(lián)合重點(diǎn)項(xiàng)目、面上項(xiàng)目，及國(guó)家海洋公益性行業(yè)科研專項(xiàng)項(xiàng)目等國(guó)家級(jí)項(xiàng)目39項(xiàng)；高校博士點(diǎn)基金博導(dǎo)項(xiàng)目、福建省重大、重點(diǎn)、自然科學(xué)基金等省部級(jí)課題70余項(xiàng)；服務(wù)地方企事業(yè)合作橫向課題50余項(xiàng)；廳級(jí)、校級(jí)及其它各類科研項(xiàng)目100余項(xiàng)；累計(jì)科研經(jīng)費(fèi)5000多萬(wàn)元；發(fā)表的論文被SCI、EI收錄200余篇；申請(qǐng)中國(guó)發(fā)明專利獲授權(quán)60余項(xiàng)；獲福建省、廈門(mén)市及泉州市科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)近10項(xiàng)。

化工學(xué)院的國(guó)際交流不僅包括與國(guó)（境）外高校合作辦學(xué)、互派交換生，邀請(qǐng)專家來(lái)訪交流合作，派出教師參加學(xué)科主流國(guó)際會(huì)議、到國(guó)外名校訪學(xué)進(jìn)修等，目前化工學(xué)院還致力于組建中外聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室、申報(bào)中外合作項(xiàng)目等工作。2013年化工學(xué)院與瑞典烏普薩拉大學(xué)簽署合作交流協(xié)議，開(kāi)展生物教育合作；泰國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)、臺(tái)灣聯(lián)合大學(xué)、中原大學(xué)來(lái)訪開(kāi)展教學(xué)與科研合作交流。連續(xù)兩年邀請(qǐng)美國(guó)三院院士哈佛大學(xué)David Weitz教授來(lái)訪講學(xué)并頒發(fā)榮譽(yù)教授證書(shū)，近五年來(lái)累計(jì)邀請(qǐng)美國(guó)科學(xué)院、工程院、藝術(shù)與科學(xué)學(xué)院院士、澳大利亞工程院院士、法國(guó)國(guó)家藥學(xué)科學(xué)院院士、捷克科學(xué)院院士、華盛頓大學(xué)波音教授等20余名國(guó)（境）外專家來(lái)訪講學(xué)交流。近五年來(lái)派出化工學(xué)院骨干教師連續(xù)參加美國(guó)化學(xué)工程師協(xié)會(huì)（AIChE）年會(huì)、國(guó)際化工與過(guò)程工程大會(huì)（CHISA）、美國(guó)化學(xué)學(xué)會(huì)（ACS）年會(huì)、世界生物材料大會(huì)（WBC）等國(guó)際主流會(huì)議并做口頭報(bào)告或邀請(qǐng)報(bào)告等20余人次，與美國(guó)哈佛大學(xué)、麻省理工學(xué)院、密西根大學(xué)、伊利諾伊大學(xué)香檳分校、佐治亞理工學(xué)院、MD安德森癌癥中心，加拿大滑鐵盧大學(xué)、拉瓦爾大學(xué)，瑞典于默奧大學(xué)及瑞士農(nóng)科院等成功建立了良好的國(guó)際合作交流關(guān)系。

化工學(xué)院的辦學(xué)定位為扎根廈門(mén)，立足福建，同時(shí)面向海內(nèi)外，打造為省內(nèi)一流，國(guó)內(nèi)外有一定影響力，具有本、碩、博三個(gè)層次的人才培養(yǎng)以及博士后研究的教學(xué)研究性學(xué)院。

在新的發(fā)展時(shí)期，化工學(xué)院將秉承和實(shí)踐“科學(xué)、民主、拼搏、創(chuàng)新”的理念，勵(lì)精圖治，團(tuán)結(jié)奮斗，不斷提高教學(xué)、科研、管理水平和人才培養(yǎng)水平，實(shí)現(xiàn)“科學(xué)建院，民主治院，拼搏興院，創(chuàng)新強(qiáng)院”，為國(guó)家的繁榮昌盛做出更大的貢獻(xiàn)。