中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院的前身是始建于清末的京師大學(xué)堂農(nóng)科大學(xué)農(nóng)學(xué)門(mén)，已經(jīng)有102年的歷史。1949年由北京大學(xué)農(nóng)學(xué)院、清華大學(xué)農(nóng)學(xué)院、華北大學(xué)農(nóng)學(xué)院相關(guān)院系合并組建為北京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)藝學(xué)系、植物病理學(xué)系、昆蟲(chóng)學(xué)系和園藝學(xué)系，并設(shè)置相應(yīng)的本科專(zhuān)業(yè)。

1952年，隨著全國(guó)性的高等學(xué)校院系調(diào)整，將原來(lái)的系和專(zhuān)業(yè)調(diào)整為農(nóng)學(xué)系（設(shè)農(nóng)學(xué)專(zhuān)業(yè)）、園藝系（設(shè)果樹(shù)蔬菜、造園2專(zhuān)業(yè)）、植物保護(hù)系（設(shè)植物保護(hù)專(zhuān)業(yè)）。1958年，學(xué)校進(jìn)行系和專(zhuān)業(yè)調(diào)整，調(diào)整為農(nóng)學(xué)系（設(shè)農(nóng)學(xué)專(zhuān)業(yè)、農(nóng)業(yè)植物生理及生物化學(xué)專(zhuān)業(yè)、作物遺傳選種及良種繁育專(zhuān)業(yè)），園藝系（設(shè)果樹(shù)園林專(zhuān)業(yè)、蔬菜栽培專(zhuān)業(yè)），植物保護(hù)與農(nóng)業(yè)微生物學(xué)系（設(shè)植物病理專(zhuān)業(yè)、農(nóng)業(yè)昆蟲(chóng)專(zhuān)業(yè)、農(nóng)業(yè)微生物專(zhuān)業(yè)）。

1986年學(xué)校進(jìn)行機(jī)構(gòu)改革和院系調(diào)整，設(shè)農(nóng)學(xué)系（農(nóng)學(xué)專(zhuān)業(yè)、作物遺傳育種專(zhuān)業(yè)、農(nóng)業(yè)氣象專(zhuān)業(yè)），園藝系（果樹(shù)專(zhuān)業(yè)、蔬菜專(zhuān)業(yè)、觀賞園藝專(zhuān)業(yè)），植物保護(hù)系（植物病理專(zhuān)業(yè)、農(nóng)業(yè)昆蟲(chóng)專(zhuān)業(yè)）。1995年學(xué)校將農(nóng)學(xué)系、園藝系、植物保護(hù)系合并為植物科技學(xué)院，按照農(nóng)學(xué)專(zhuān)業(yè)、作物遺傳育種專(zhuān)業(yè)、植物病理專(zhuān)業(yè)、農(nóng)業(yè)昆蟲(chóng)專(zhuān)業(yè)、果樹(shù)專(zhuān)業(yè)、蔬菜專(zhuān)業(yè)、觀賞園藝專(zhuān)業(yè)等專(zhuān)業(yè)招生培養(yǎng)。1999年，學(xué)校又將原農(nóng)學(xué)系、園藝系、植物保護(hù)系分別調(diào)整為作物學(xué)院、植物保護(hù)學(xué)院和園藝學(xué)院。

中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院學(xué)專(zhuān)業(yè)、植物保護(hù)專(zhuān)業(yè)和園藝專(zhuān)業(yè)招生和培養(yǎng)，但具體按照作物栽培學(xué)與耕作學(xué)、作物遺傳育種、植物病理學(xué)、昆蟲(chóng)學(xué)、植保與植物檢疫、果樹(shù)學(xué)、蔬菜學(xué)等專(zhuān)業(yè)方向進(jìn)行培養(yǎng)。2001年園藝學(xué)院新增園林專(zhuān)業(yè)、2002年作物學(xué)院新增種子科學(xué)與工程專(zhuān)業(yè)。