吉林大學(xué)在東北亞研究方面具有較長的歷史。1964年，經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，吉林大學(xué)成立了日本問題研究室和朝鮮問題研究室。20世紀(jì)70年代以來，吉林大學(xué)先后成立了日本研究所、朝鮮研究所（后更名為：朝鮮韓國研究所）、蘇聯(lián)研究所（后更名為：俄羅斯研究所）、人口研究所、區(qū)域經(jīng)濟(jì)研究所、圖們江地區(qū)開發(fā)研究所，對東北亞地區(qū)的日本、朝鮮、韓國、俄羅斯、蒙古開展研究。

1994年4月，吉林大學(xué)將日本研究所、朝鮮韓國研究所、俄羅斯研究所、人口研究所、圖們江國際開發(fā)研究所、區(qū)域經(jīng)濟(jì)研究所合并，成立了東北亞研究院。

1997年，東北亞研究院入選國家“211工程”重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科建設(shè)項目，順利完成“東北亞區(qū)域政治、經(jīng)濟(jì)、歷史與社會發(fā)展研究”一期、二期、三期項目建設(shè)。

1999年l0月，以東北亞研究院為依托，聘任了校內(nèi)外從事世界經(jīng)濟(jì)、國際政治、東北亞歷史等方面的研究人員，成立了吉林大學(xué)東北亞研究中心。1999年 12月，吉林大學(xué)東北亞研究中心經(jīng)國家教育部批準(zhǔn)，成為首批十五家普通高等學(xué)校人文社會科學(xué)重點(diǎn)研究基地之一。2003年和2009年，東北亞研究中心順利通過教育部驗收，并于2009年11月被評為優(yōu)秀重點(diǎn)研究基地。

2005年，東北亞研究院入選“985工程”“二期”哲學(xué)社會科學(xué)創(chuàng)新基地，成立了“東北亞研究與東北振興哲學(xué)社會科學(xué)創(chuàng)新基地”，2010年改稱為“東北亞區(qū)域合作與長吉圖發(fā)展戰(zhàn)略創(chuàng)新基地”，同時成立“中國人口老齡化研究創(chuàng)新基地”。

2011年6月，吉林大學(xué)以東北亞研究院為依托成立“東北亞區(qū)域研究協(xié)同創(chuàng)新中心”，通過國內(nèi)外研究單位在人才、學(xué)科、科研方面的優(yōu)勢互補(bǔ)、協(xié)同合作，提升對東北亞間重大問題研究、人才培養(yǎng)、學(xué)科發(fā)展的綜合創(chuàng)新能力。

東北亞研究院致力于推動各種形式的國際交流與合作，目前已與美國、日本、朝鮮、韓國、俄羅斯、蒙古等國家的大學(xué)和研究機(jī)構(gòu)簽訂了交流協(xié)議，通過互派學(xué)者和留學(xué)生、開展共同研究、交換資料，共同組織召開國際學(xué)術(shù)會議等形式，促進(jìn)東北亞問題的研究。

經(jīng)過多年的發(fā)展，圍繞東北亞地區(qū)重大理論問題和現(xiàn)實問題，充分發(fā)揮對東北亞區(qū)域經(jīng)濟(jì)、政治、歷史與社會發(fā)展領(lǐng)域多學(xué)科綜合研究的優(yōu)勢，服務(wù)于國家重大戰(zhàn)略需求和社會經(jīng)濟(jì)發(fā)展需求，東北亞研究院逐步成長為以國際問題研究為主、多學(xué)科交叉、在國內(nèi)外有較大影響力的專職研究機(jī)構(gòu)。

東北亞研究院現(xiàn)有教職工83人，專職科研人員61人，其中教授32人(含博士生導(dǎo)師27人)，副教授21人，講師8人；有“哲學(xué)社會科學(xué)資深教授”1 人，國務(wù)院學(xué)位委員會學(xué)科評議組成員1人，教育部社會科學(xué)委員會委員1人，教育部跨世紀(jì)人才1人，吉林省省管專家4人，吉林省拔尖創(chuàng)新人才3人，吉林省有突出貢獻(xiàn)的中青年專業(yè)技術(shù)人才2人，吉林大學(xué)“匡亞明特聘教授”2人，吉林大學(xué)“匡亞明講座教授”3人。目前已經(jīng)形成了結(jié)構(gòu)合理、實力雄厚的研究梯隊和教師隊伍。

東北亞研究院現(xiàn)有世界經(jīng)濟(jì)、區(qū)域經(jīng)濟(jì)學(xué)、人口·資源與環(huán)境經(jīng)濟(jì)學(xué)、人口學(xué)、國際政治、世界史等六個碩士和博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，共培養(yǎng)博士研究生621人，碩士研究生 1148人，留學(xué)生120人。目前在校的博士研究生282人，碩士研究生226人，留學(xué)生31人。2004年開始，受教育部委托，東北亞研究院的世界經(jīng)濟(jì)專業(yè)招收和培養(yǎng)韓國碩士、博士研究生。在學(xué)期間，用韓國語和漢語雙語授課，學(xué)生們用韓國語撰寫論文和答辯。

新世紀(jì)以來，獲國家社會科學(xué)基金重大招標(biāo)項目2項、國家社科基金項目14項、國家自然科學(xué)基金項目1項、教育部重大攻關(guān)項目1項、教育部其他項目38項、吉林省社會科學(xué)基金項目33項、其他部委及橫向課題110項，獲省部級獎41項，出版學(xué)術(shù)著作128部、在國內(nèi)外刊物上公開發(fā)表論文1590篇，提交并被采納研究報告205篇，充分發(fā)揮了為國家決策部門提供咨詢意見、服務(wù)于地方經(jīng)濟(jì)建設(shè)的作用。