吉林大學生物與農業工程學院的前身，是始建于1955年的長春汽車拖拉機學院的農業機械專業和拖拉機專業。生物與農業工程學院自1957年開始招收本科生，60年代開始培養碩士研究生，1981年建立農業機械設計制造博士點，1989年建立農業工程博士后流動站，歷經長春汽車拖拉機學院農業機械系、吉林工業大學農機工程學院，于2001年5月，農業工程及其相關學科組建了吉林大學生物與農業工程學院。60年來，特別是經過“211工程”和“985工程”建設，生物與農業工程學院在學科建設、師資隊伍建設、人才培養、科學研究、平臺與基地建設、國內外合作與交流以及社會服務等方面取得了可喜的成績。

生物與農業工程學院先后設置了農業機械化工程、農業生物環境與能源工程、農業電氣化與自動化、仿生科學與工程以及食品科學與工程、農林經濟管理、發酵工程等研究生學科，設置了農業機械化及其自動化、食品科學與工程、食品質量與安全、生物工程、包裝工程、農林經濟管理等本科專業。農業機械化工程從1988年至今一直是國家重點學科，并且是教育部“長江學者獎勵計劃”設崗并上崗學科。農業工程一級學科在教育部歷次學科評估中名列前茅。在2014年吉林大學一流學科建設立項過程中，農業工程被列為高峰學科、仿生科學與工程被列為特色交叉學科。2017年國家“雙一流”建設啟動，農業工程和仿生科學與工程學科進入經教育部批準、吉林大學自主建設的國家一流學科“機械與仿生工程學科群”。農業機械化及其自動化本科專業是教育部卓越工程師培養首批試點專業、農林經濟管理本科專業是教育部卓越農林人才教育培養計劃改革試點專業。“仿生科學與工程”被列為新興交叉學科，在國家“新工科”教改項目中成為試點建設的本科專業。

生物與農業工程學院形成了以任露泉院士為學科帶頭人、博士生導師和中青年博士為骨干的師資隊伍。生物與農業工程學院現有教職工138人，有教師85人，其中教授37人、副教授34人，有博士生導師30人。其中任露泉教授為中國科學院院士、國家有突出貢獻中青年專家；任露泉教授、佟金教授分別為第六屆國務院學位委員會機械工程、農業工程學科評議組成員，楊印生教授為第七屆國務院學位委員會農業工程學科評議組成員；佟金教授、韓志武教授為教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授、國家杰出青年科學基金獲得者、國家百千萬人才工程第一、二層次入選者；佟金教授是教育部高等學校農業工程類專業教學指導委員會副主任委員，楊印生教授是教育部高等學校農業經濟管理類專業教學指導委員會委員。2016年8月，羅錫文、陳學庚作為吉林大學雙聘院士加盟生物與農業工程學院。另外，還有“長江學者獎勵計劃”講座教授1人，科技部中青年科技創新領軍人才1人，國家優秀青年科學基金獲得者1人，“長白山學者”特聘教授3人，唐敖慶特聘（講座）教授12人。

生物與農業工程學院建有工程仿生教育部重點實驗室、吉林省普通高等學校智能化農業裝備與技術重點實驗室等基礎研究創新基地4個，建有工程仿生國家地方聯合工程實驗室、吉林省智能農產品生產裝備與技術工程實驗室等應用研究創新基地10個，建有“工程仿生技術與高端裝備創新引智基地”（111計劃）、吉林大學-諾丁漢大學中英聯合仿生實驗室等國際合作研究創新基地6個，建有糧食儲運國家工程實驗室成員單位、全國農業裝備產業技術創新戰略聯盟成員等協同創新平臺5個。另外還是教育部、財政部農林學科試點實踐基地建設單位，在中國農業機械化科學研究院建有國家級工程實踐教育中心。發起創建了“國際仿生工程學會”，秘書處常設在吉林大學；創辦了國際性學術刊物《JournalofBionicEngineering》（SCI、EI收錄，2017年度影響因子為2.325）；與英國曼徹斯特大學、英國諾丁漢大學、美國堪薩斯州立大學、日本筑波大學等國外10余所知名高校建立了長期的國際合作與交流關系；與中國農業機械化科學研究院、農業部規劃設計研究院、國家糧食局科學研究院、中國一拖集團有限公司等國家大型企業或科研機構建立了密切的國內合作關系。

生物與農業工程學院圍繞機械仿生理論與技術、農業工程仿生與地面機器系統、農業機械智能設計與機具創新、設施農業環境控制、農產品轉化增值與農業信息化工程、農業工程系統分析與管理工程等特色研究方向，取得了一批有影響的標志性成果。先后獲得國家級科技成果獎勵5項，如“BZ型綜合號播種機”1983年獲國家發明三等獎，“高速精密排種器及應用” 1993年獲國家發明三等獎，“高速精密播種及播前土壤處理的成套技術與裝備”2003年獲國家科學技術進步二等獎，“地面機械脫附減阻仿生技術”2006年獲國家技術發明二等獎，“仿生耦合多功能表面構建原理與關鍵技術”2013年獲國家技術發明二等獎。

生物與農業工程學院一直把人才培養質量視為本科生和研究生教育的生命線，先后獲得國家級教學成果二等獎2項和全國百篇優秀博士學位論文提名2篇。我院培養的人才分布在政府機關、企事業單位等各個部門，有的已經成為政府機關的主要領導人，有的已經成為著名的企業家，還有相當數量的畢業生已經成為國內知名的學科帶頭人、國外著名或知名大學的教授、國外著名企業的高級研究或管理人員。